11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80553 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  100 
 
 		 1348 aa  2731    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  20.95 
 
 		 1927 aa  99  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  34.34 
 
 		 951 aa  82.4  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  19.39 
 
 		 1962 aa  77.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  33.79 
 
 		 1000 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  42.28 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  35.47 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  26.95 
 
 		 1689 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  35.12 
 
 		 402 aa  56.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 427 aa  45.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 		 4238 aa  45.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>