16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82631 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1092    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  27.37 
 
 
766 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01064  Nuclear pore complex protein An-Nup57 (Eurofung)  26.67 
 
 
441 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.147988 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  44.03 
 
 
951 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  38.28 
 
 
1000 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01040  hypothetical protein  27.05 
 
 
581 aa  84  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  39.04 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  34.76 
 
 
1689 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  41.05 
 
 
1927 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  41.28 
 
 
1348 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  40.85 
 
 
1962 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  37.06 
 
 
727 aa  54.3  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  40.65 
 
 
477 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02431  Nuclear pore complex protein An-Nup49 (Eurofung)  37.71 
 
 
473 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 
2094 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43774  predicted protein  43.33 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>