14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66703 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  100 
 
 		 402 aa  793    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  41.98 
 
 		 766 aa  73.6  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  38.97 
 
 		 1000 aa  72.8  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  43.27 
 
 		 951 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  27.76 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  36.36 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  38.7 
 
 		 1927 aa  63.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  36.89 
 
 		 1348 aa  63.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  34.85 
 
 		 727 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01040  hypothetical protein  36.76 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  28.65 
 
 		 3151 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  36.64 
 
 		 624 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  33 
 
 		 1689 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  28.64 
 
 		 1556 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>