17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29138 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  100 
 
 
766 aa  1442    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  28.12 
 
 
551 aa  138  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  33.61 
 
 
1000 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01040  hypothetical protein  27.79 
 
 
581 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  40.98 
 
 
951 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  27.57 
 
 
402 aa  79.7  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  40.62 
 
 
1689 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  38.04 
 
 
1348 aa  71.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  35.62 
 
 
624 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  41.32 
 
 
477 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43774  predicted protein  25.9 
 
 
406 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  30.13 
 
 
1927 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  34.96 
 
 
1556 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03230  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
750 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82669  Nucleoskeletal protein  29.06 
 
 
1019 aa  45.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.744572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  29.44 
 
 
538 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02431  Nuclear pore complex protein An-Nup49 (Eurofung)  32.1 
 
 
473 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>