13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03230 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03230  conserved hypothetical protein  100 
 
 
750 aa  1422    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  33.14 
 
 
624 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  30.94 
 
 
727 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50425  predicted protein  24.89 
 
 
509 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  38.51 
 
 
766 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  34.74 
 
 
951 aa  58.9  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  36.68 
 
 
1000 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  36.84 
 
 
551 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf469  massive surface protein MspC  21.67 
 
 
2719 aa  47.8  0.0008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82669  Nucleoskeletal protein  32.14 
 
 
1019 aa  47.4  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.744572 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  39.38 
 
 
1689 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  47.14 
 
 
477 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  35.86 
 
 
1927 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>