16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01140 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  100 
 
 		 1927 aa  3875    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  27.88 
 
 		 1962 aa  318  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  31.93 
 
 		 951 aa  250  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  26.32 
 
 		 1689 aa  187  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  33.55 
 
 		 1000 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  20.95 
 
 		 1348 aa  99  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26409  predicted protein  26.82 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  33.43 
 
 		 766 aa  78.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  37.2 
 
 		 551 aa  74.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01040  hypothetical protein  39.24 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  41.94 
 
 		 477 aa  62  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  38.54 
 
 		 402 aa  61.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 		 2094 aa  59.3  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  35.1 
 
 		 624 aa  53.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  32.39 
 
 		 727 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  31.56 
 
 		 1803 aa  48.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>