60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0699 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  52.59 
 
 		 208 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  36.55 
 
 		 210 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  34.8 
 
 		 172 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  35.59 
 
 		 113 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  40.87 
 
 		 113 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  33.61 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  34.13 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  34.45 
 
 		 113 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  37.93 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  34.26 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  32.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  36.61 
 
 		 103 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  57  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  37.66 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  32.31 
 
 		 137 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  27.83 
 
 		 116 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  29.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  29.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  29.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  30.36 
 
 		 118 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  31.15 
 
 		 127 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  41.61 
 
 		 514 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  26.96 
 
 		 122 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  32.73 
 
 		 139 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  33.63 
 
 		 123 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  27.68 
 
 		 118 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  27.68 
 
 		 118 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  27.68 
 
 		 118 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  27.68 
 
 		 118 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  43.28 
 
 		 125 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  26.97 
 
 		 2851 aa  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.97 
 
 		 122 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  28.09 
 
 		 1646 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  47.19 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  25.93 
 
 		 127 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  26.72 
 
 		 119 aa  47  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  28.87 
 
 		 113 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  32.32 
 
 		 213 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  33.93 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  33.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  28.18 
 
 		 186 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.96 
 
 		 14916 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>