52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2606 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  43.52 
 
 
116 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  43.52 
 
 
116 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  44.76 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  36.61 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  36.97 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  34.96 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  34.45 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  33.64 
 
 
249 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  31.13 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  39.77 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  32.08 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  33.73 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  30.09 
 
 
210 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  27.43 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  33.66 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  34.74 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  36.14 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  26.55 
 
 
130 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  26.32 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  33.78 
 
 
190 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  26.79 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  24.78 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  26.79 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  26.79 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  26.79 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  30.86 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  23.89 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  23.89 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  23.89 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  27.71 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  27.71 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  26.32 
 
 
122 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  28.87 
 
 
442 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  32.41 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  31.3 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  30.56 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  31.46 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  28.47 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  28.47 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  28.74 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  28.74 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  38.67 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  29.21 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  31.18 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  28.04 
 
 
243 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>