53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  33.61 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  45.67 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  36.29 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  32.74 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  35.77 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  39.34 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  37.04 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  34.15 
 
 
113 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  35 
 
 
187 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  36.89 
 
 
122 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  28.5 
 
 
179 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  43 
 
 
123 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  36.46 
 
 
122 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  32.38 
 
 
122 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  32.38 
 
 
130 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  36.22 
 
 
130 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  30.83 
 
 
116 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  30.07 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  31.5 
 
 
139 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  27.11 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  32.79 
 
 
122 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  32.79 
 
 
122 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  30.43 
 
 
118 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  31.15 
 
 
123 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  30.25 
 
 
118 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  30.25 
 
 
118 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  30.25 
 
 
118 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  29.84 
 
 
118 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  36.46 
 
 
103 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  29.29 
 
 
121 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  32.32 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  28.23 
 
 
127 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  28.97 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  32.67 
 
 
177 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1370  hypothetical protein  30.47 
 
 
151 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  32.61 
 
 
113 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  26.83 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  26.83 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  26.83 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  31.75 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  26.83 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  25.31 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  28.85 
 
 
139 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>