35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2816 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1677  hypothetical protein  59.66 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0497  hypothetical protein  47.01 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.980208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  27.64 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  28 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  32.8 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  29.06 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  29.06 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  30.07 
 
 
243 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  30 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  30 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  37.27 
 
 
249 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  31.94 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  31.09 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  30.4 
 
 
225 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  26.5 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  25.6 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  26.77 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  37.66 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  25.62 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  31.67 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  27.64 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  25.62 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  27.59 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  25.71 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  25.42 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  30.51 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  24.78 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  26.13 
 
 
122 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  26.13 
 
 
122 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1451  hypothetical protein  29.2 
 
 
277 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963117  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  26.32 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>