68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2198 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  363  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  42.24 
 
 
123 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  42.24 
 
 
123 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  35.83 
 
 
172 aa  87.8  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  33.12 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  41.8 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  39.39 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  35.65 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  36.8 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  40.94 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  41.46 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  43.37 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  33.87 
 
 
243 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  42.48 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  42.17 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  42.17 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  42.17 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  36.29 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  31.53 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  31.39 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  28.88 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  19.58 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  33.93 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  40.96 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  31.25 
 
 
116 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  35.34 
 
 
125 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  34.94 
 
 
113 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  34.03 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  35.2 
 
 
139 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  34.94 
 
 
106 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  30.65 
 
 
139 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  35.65 
 
 
113 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  29.73 
 
 
127 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  34.15 
 
 
113 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  28.48 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  28.77 
 
 
137 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  27.97 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  30.22 
 
 
139 aa  47.8  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  33.94 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  46.2  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  32.65 
 
 
125 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  32.56 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  24.86 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  22.52 
 
 
121 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  35.06 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  37.5 
 
 
1821 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  30.39 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5457  hypothetical protein  29.61 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  38.81 
 
 
1643 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  37.29 
 
 
824 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>