72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4385 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  247  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  75.61 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  73.98 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  66.94 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  62.6 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  57.72 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  57.72 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  69.11 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  56.56 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  42.5 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  43.24 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  51 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  41.44 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  42.02 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  42.02 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  49.15 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  35.2 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  43.59 
 
 		 187 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  41.74 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  41.23 
 
 		 249 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  48.65 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  39.5 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  28.21 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  31.34 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  32.69 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  39.32 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  35.54 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  35.54 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  41.13 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  27.52 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  31.4 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  39.34 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  34.19 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  34.75 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  28.3 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  32.28 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  39.74 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  27.64 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  32.74 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  34.55 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1606  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  31.3 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  28.85 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  25.89 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  35.87 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  31.78 
 
 		 190 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  27.82 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  32.48 
 
 		 442 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  28.69 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  30.25 
 
 		 196 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12573  tRNA modification GTPase  35.85 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>