70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4796 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  80 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  81.9 
 
 		 106 aa  183  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  67.83 
 
 		 116 aa  176  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  59.65 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  56.14 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  59.65 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  59.65 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  58.77 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  56.78 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  44.63 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  43.8 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  46 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  42.06 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  42.06 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  38.74 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  38.74 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  38.18 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  35.51 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  34.4 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  30.47 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  42.59 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  32.41 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  30.4 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  37.65 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  32.14 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  30.14 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  30.14 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  41.96 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  33.93 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  39.29 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  23.29 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  37.07 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  30.61 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  33.61 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  32.76 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  30.17 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  39.77 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  28.91 
 
 		 442 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  29.46 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  32.38 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  52  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  26.55 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  31.3 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12573  tRNA modification GTPase  25.23 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  28.93 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  28.43 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  25.62 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5457  hypothetical protein  29.2 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  23.4 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0796  putative acyltransferase  23.73 
 
 		 147 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1187  putative acyltransferase  23.73 
 
 		 147 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>