67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  56.56 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  56.67 
 
 
123 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  56.67 
 
 
123 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  47.93 
 
 
122 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  47.93 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  44.25 
 
 
122 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  44.25 
 
 
122 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  50.82 
 
 
122 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  40.35 
 
 
113 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  49.04 
 
 
103 aa  97.1  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  34.26 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  36.75 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  32.41 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  34.23 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  34.26 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  38.79 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  45.98 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  35.2 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  38.6 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  32.67 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  34.62 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  31.17 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  26.96 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  32.52 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  33.62 
 
 
210 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  25.45 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  32.52 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  30.58 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  31.16 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  36.46 
 
 
243 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  32.65 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  34.07 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  24.38 
 
 
159 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  28.93 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1606  hypothetical protein  32.2 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  33.78 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  36.21 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  31.67 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  31.97 
 
 
442 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  32.65 
 
 
190 aa  48.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  28.33 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  25.6 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  33.65 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  34.33 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  30.23 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  34.75 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  29.57 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  33.72 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  26.55 
 
 
186 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4462  hypothetical protein  30.09 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>