50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  32.14 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  28.5 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  30.71 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  38.33 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  31.4 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  32.62 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  29.73 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  29.73 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  24.16 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  30.97 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  30.47 
 
 		 113 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  29.92 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  26.92 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  36.19 
 
 		 106 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  26.98 
 
 		 113 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  34.09 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  27.47 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  31.48 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  25 
 
 		 113 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  26.21 
 
 		 127 aa  44.3  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.2 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  26.06 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  22.3 
 
 		 139 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  26 
 
 		 159 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  29.03 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  30.16 
 
 		 125 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  26.14 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>