46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0194 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  317  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  32.19 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  30.82 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  30.14 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  32.03 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32.45 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  29.56 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  32.87 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  30.14 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  27.22 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  29.56 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  29.5 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  30.19 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  30 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  27.56 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  27.59 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  26.75 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  25.18 
 
 
122 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  25.18 
 
 
122 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  29.87 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  27.52 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1606  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  25.16 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  28.35 
 
 
149 aa  57.4  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  37.3 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  37.3 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  24 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  23.53 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  24.16 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12573  tRNA modification GTPase  42.59 
 
 
112 aa  44.7  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  34.57 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  23.61 
 
 
243 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  42  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  23.75 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>