51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1970 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  31.72 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  34.44 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  28.08 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  35.46 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  35.46 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  26.03 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  32.69 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  29.45 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  28.89 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  29.93 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  23.29 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  28.9 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  32.67 
 
 		 122 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  27.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  31.01 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  28.77 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  27.33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  29.79 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  29.93 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  20.8 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  29.01 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1606  hypothetical protein  28.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  32.89 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  26.95 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  23.6 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  23.6 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  32.53 
 
 		 133 aa  47.4  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  25.17 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  40.68 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0497  hypothetical protein  31.94 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.980208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  22.64 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  24.84 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  20.44 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  25.68 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  26.21 
 
 		 123 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  25.85 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>