38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2238 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  289  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  84.89 
 
 
139 aa  253  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  44.2 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  33.83 
 
 
210 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  39.5 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  40.71 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  35.34 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  34.48 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  37.84 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  34.21 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  37.84 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  34.21 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  33.63 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  33.63 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  32.17 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  33.04 
 
 
249 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  33.06 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  31.09 
 
 
187 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  38.53 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  32.52 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  26.5 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  27.97 
 
 
186 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  31.5 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  30.88 
 
 
442 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  31.3 
 
 
208 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  33.94 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  32.41 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  29.06 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  25.71 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  24.84 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  29.06 
 
 
225 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  31.08 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  29.6 
 
 
143 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  23.4 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>