61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3457 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  89.38 
 
 
225 aa  209  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  40.87 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  35.04 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  41.03 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  39.32 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  32.46 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  38.14 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  34.15 
 
 
243 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  35.78 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  36.94 
 
 
249 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  32.76 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  32.17 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  31.03 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  32.76 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  34.62 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  29.31 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  35.65 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  34.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  30.58 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  38.52 
 
 
208 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  38.14 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  33.63 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  32.8 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  25.86 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  30.43 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  33.63 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  31.11 
 
 
121 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  33.91 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  29.91 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  25.22 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  25.22 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  25.22 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  25.22 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  26.13 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  26.13 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  26.13 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  30.51 
 
 
113 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  31.67 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  29.06 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  38.18 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  23.31 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  34.88 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  27.38 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  44.62 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  28.45 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  30.23 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  31.18 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  25.81 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>