28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1606 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1606  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32.39 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  30.99 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  29.86 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  32.17 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  30.99 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  30.99 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.51 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  32.35 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  28.87 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  28.46 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  27.19 
 
 
116 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  30.88 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  26.15 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  25 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  26.45 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  25.45 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  26.45 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  26.45 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>