66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4405 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  80 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  72.17 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  78.1 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  58.41 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  58.41 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  58.41 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  58.41 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  56.14 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  55.46 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  40.98 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  42.61 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  43.64 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  41.44 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  37.27 
 
 		 113 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  36.07 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  33.58 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  34.45 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  34.26 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  27.68 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  33.03 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  25.52 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  29.31 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  33.91 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  32.46 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  36.36 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  31.03 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  38.64 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  32.71 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  32.38 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  26.96 
 
 		 442 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  26.09 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12573  tRNA modification GTPase  28.83 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  26.32 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  30.39 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  25.62 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  28.28 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  28.93 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0796  putative acyltransferase  24.81 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1187  putative acyltransferase  24.81 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>