58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5241 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  43.08 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  35.18 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  31.02 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  31.31 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  34.31 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  30.15 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  52.54 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  37.08 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  34.07 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  41.67 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  45.57 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  34 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  43.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  36.76 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  41.38 
 
 		 141 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  39.73 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  41.51 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  38.96 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  47.17 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  30.28 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  39.71 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  28.69 
 
 		 123 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  32.32 
 
 		 442 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  27.87 
 
 		 123 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  30.34 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  46.27 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  27.59 
 
 		 113 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  28.83 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  44.68 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  38.98 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  25.31 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  29.07 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  29.07 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  21.3 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  29.57 
 
 		 122 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  27.61 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  34.62 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  39.19 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  39.44 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  52.83 
 
 		 242 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  43.55 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  26.97 
 
 		 122 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>