47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1465 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  52.38 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  51.85 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  45.33 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  41.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  53.45 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  46.3 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  47.46 
 
 		 211 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  41.11 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  45.76 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  44.78 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  47.69 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  54.9 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  42.03 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  49.18 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  41.82 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  46.27 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  42.59 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  41.79 
 
 		 200 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  49.06 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  42.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  49.06 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  49.06 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  34.78 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  46.55 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  43.4 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  47.37 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  44.62 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  34.78 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  32.59 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  40.3 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  45.61 
 
 		 218 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  39.29 
 
 		 146 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  41.38 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  39.53 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  39.53 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  38.6 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  43.1 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  40.85 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>