82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1934 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  53.43 
 
 
215 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  45.02 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  47.74 
 
 
209 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  45.41 
 
 
218 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  40.49 
 
 
231 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  43.43 
 
 
200 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  42.5 
 
 
206 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  44.57 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  41.06 
 
 
214 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  40.4 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  40.59 
 
 
215 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  37.37 
 
 
200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  38.59 
 
 
217 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  37.88 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  34.67 
 
 
193 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  34.78 
 
 
242 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  35.18 
 
 
198 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  31.13 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  31.44 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  36.36 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  32.21 
 
 
229 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  32.21 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  34.36 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  32.32 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  30.21 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  30.05 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  28.93 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  29.25 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  25.15 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  33.65 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  34.36 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  29.85 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  29.85 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  29.85 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  31.63 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  31.47 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  32.18 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  30 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  27.46 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  30.05 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  32.68 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  28.78 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  28.26 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  27.41 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  28.71 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  29.77 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  27.94 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  29.81 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  45.16 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  27.78 
 
 
196 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  37.63 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  45.98 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  37.08 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  35.8 
 
 
148 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  40.79 
 
 
146 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  26.44 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  52.83 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  39.56 
 
 
141 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  26.7 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  37.93 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  37.8 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  26.92 
 
 
183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  33.72 
 
 
270 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  34.12 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  34.78 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  45.71 
 
 
161 aa  45.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  47.17 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  40.24 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  44.64 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  25.37 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  35.82 
 
 
166 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  29.6 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  40.68 
 
 
154 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  33.98 
 
 
130 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>