37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1660 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  40.72 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  26.53 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  26.53 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  26.53 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  26.42 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  27.04 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  24.88 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  25.81 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  25.51 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  25.13 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  26.4 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  25.13 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  25.62 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  26.11 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  21.72 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  22.77 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  25.15 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  26.06 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  23.26 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  26.02 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  24.26 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  22.61 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  25.26 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  38.6 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  23.7 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  24.18 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  30.91 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  25.13 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  30.91 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  30.97 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  24.62 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  27.19 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  24.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  21.32 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  22.11 
 
 		 229 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>