54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5207 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  34.21 
 
 
215 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  33.52 
 
 
206 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  36.25 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  34.71 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  31.22 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  33.16 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  33.94 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  32.86 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  34.24 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  35.06 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  33.87 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  34.97 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  34.85 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  29.38 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  30.17 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  32.17 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  34.27 
 
 
198 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  30.85 
 
 
206 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  33.83 
 
 
208 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  35.25 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  31.9 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  32.21 
 
 
183 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  27.22 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  30.92 
 
 
200 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  37.19 
 
 
175 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  29.53 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  29.15 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  27.74 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  28.4 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  31.21 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  27.23 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  37.07 
 
 
196 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  29.93 
 
 
205 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  56.1 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  27.75 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  42.37 
 
 
162 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
211 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  42.86 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  31.06 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  34.85 
 
 
217 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  25.87 
 
 
217 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  32.85 
 
 
175 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  46.51 
 
 
147 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>