68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12878 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  77.09 
 
 
211 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  75.98 
 
 
200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  74.05 
 
 
209 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  74.05 
 
 
209 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  74.05 
 
 
209 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  40.33 
 
 
191 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  38.12 
 
 
190 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  33.5 
 
 
200 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  32.66 
 
 
219 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  35.96 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  30.68 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.59 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  29.38 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  34.85 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  33.68 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  31 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  30.6 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  28.43 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  30.3 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  30.85 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  28.35 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  29.44 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  29.84 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  30.82 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  31.69 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  31.49 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  35.34 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  29.67 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  29.67 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  29.67 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  28.18 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  32.07 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  28.49 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  26.74 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  31.67 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  29.79 
 
 
229 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  29.65 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  26.46 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
234 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  30.6 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  28.95 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  27.94 
 
 
217 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  27.51 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  28 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  30.56 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  27.14 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  33.7 
 
 
230 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  24.87 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  37.35 
 
 
130 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  28.49 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  25.27 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  27.32 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  25.97 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  38.1 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  29.63 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  23.67 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  35.48 
 
 
128 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  47.17 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  30.59 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  27.69 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  31.06 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  43.4 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  34.12 
 
 
147 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>