89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2118 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  286  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  46.59 
 
 
179 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  48.18 
 
 
161 aa  116  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  40.71 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  37.72 
 
 
214 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  51.95 
 
 
219 aa  66.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  43.75 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  32.65 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  51.52 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  51.52 
 
 
206 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  53.57 
 
 
215 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  55.17 
 
 
217 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  50.79 
 
 
218 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  44.16 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  40.54 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  30.94 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  47.89 
 
 
209 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  41.43 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  35.96 
 
 
229 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  42.11 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  48.57 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  52.83 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  46.77 
 
 
276 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  39.39 
 
 
200 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  48.33 
 
 
206 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  34.95 
 
 
200 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  51.79 
 
 
206 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  31.65 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  32.21 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  47.27 
 
 
204 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  34 
 
 
227 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  40.35 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  30.53 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  36.11 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  47.76 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  32.03 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  31.2 
 
 
155 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  44.78 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
231 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  31.2 
 
 
155 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  31.2 
 
 
155 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  36.49 
 
 
292 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  36.49 
 
 
292 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  49.12 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  36.49 
 
 
292 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  48.08 
 
 
197 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  37.88 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
208 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  43.4 
 
 
192 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  48.08 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  48.08 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  29.01 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  36.28 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  45.16 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  40 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0043  protein of unknown function DUF1707  33.88 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  49.18 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  42.37 
 
 
234 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  49.06 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  30.59 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 
230 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  42.03 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  41.27 
 
 
289 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  43.33 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  38.89 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  40.58 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  49.06 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  39.66 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  48.21 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  43.4 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.29 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  43.86 
 
 
190 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  28.07 
 
 
200 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  41.27 
 
 
209 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  41.27 
 
 
209 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  43.66 
 
 
178 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  41.27 
 
 
209 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  43.4 
 
 
213 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6038  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  40 
 
 
181 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  46.3 
 
 
175 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>