53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0556 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 175 aa  343  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  35.9 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  37.19 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  45.07 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  52.83 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  30.6 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  44.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  31.06 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  45.07 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  55.36 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  51.56 
 
 		 128 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  32.06 
 
 		 206 aa  50.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  46.97 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  32.88 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  54.9 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  46.43 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  39.13 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  31.28 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  37.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  34.13 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  44.64 
 
 		 218 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  50.94 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  41.82 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  41.27 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  43.75 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  50.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  28.77 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  50.91 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  46.77 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  46.77 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  47.06 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  42.67 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  32.58 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  45 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  41.51 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  47.06 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  47.06 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  39.29 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  44.23 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  43.1 
 
 		 175 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  38.81 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  45.1 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  43.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  47.06 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  45.76 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>