96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2439 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  374  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  53.37 
 
 
196 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  41.08 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  35.18 
 
 
213 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  42.05 
 
 
180 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  39.22 
 
 
249 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  53.45 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  34.26 
 
 
442 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  36.14 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  31.53 
 
 
113 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  33.72 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  33.72 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  33.64 
 
 
122 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  33.64 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  34.55 
 
 
113 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  51.92 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  33.63 
 
 
113 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  43.55 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  38.81 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  41.03 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  34.58 
 
 
123 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  26.25 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  30.97 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  43.48 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  33.78 
 
 
113 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  48.08 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  49.15 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  44.23 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  41.94 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  41.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  31.78 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  44.26 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  43.1 
 
 
141 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  33.94 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  34.58 
 
 
123 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  36.49 
 
 
204 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  48.08 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  42.31 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  42.31 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  41.38 
 
 
157 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  44.23 
 
 
168 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  28.97 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  42.31 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  35.51 
 
 
122 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  40.32 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  44.29 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  40.74 
 
 
146 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  46.67 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  44.83 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  36.84 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  26.85 
 
 
116 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  26.85 
 
 
116 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  43.86 
 
 
229 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  40.38 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  44.83 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  38.89 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  47.27 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  41.38 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  45.61 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  42.31 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  40.35 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  33.72 
 
 
122 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 
142 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  26.74 
 
 
149 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  39.29 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  36.84 
 
 
183 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
230 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  30.1 
 
 
177 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  38.89 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  38.18 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  36.21 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  45.83 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  43.86 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  39.13 
 
 
200 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>