61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3291 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 
179 aa  340  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  44.1 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  39.66 
 
 
161 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  55.36 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  34.78 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  52.63 
 
 
214 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  41.89 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  34.07 
 
 
213 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  36.79 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  27.75 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  57.69 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  34.04 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  52.73 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  38.64 
 
 
211 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  32.24 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  40.43 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  39.18 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  45.16 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  29.38 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  41.18 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  26.42 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  48.28 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  51.85 
 
 
195 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  40.51 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  46.15 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  47.17 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  44.83 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  48.15 
 
 
276 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
217 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  46.15 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  47.27 
 
 
227 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  28.82 
 
 
141 aa  44.3  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  38.37 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  43.64 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  47.17 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  43.42 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  48.89 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  43.64 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  38.18 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  48.08 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  45.28 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  39.29 
 
 
215 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  38.89 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  49.06 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  41.27 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  36.36 
 
 
196 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  29.7 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  48.15 
 
 
198 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  41.67 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  39.62 
 
 
146 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  44.07 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  44.07 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  44.07 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>