107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0137 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  55.56 
 
 
217 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  48.74 
 
 
206 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  39.5 
 
 
214 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  42 
 
 
219 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  38.24 
 
 
218 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  36.73 
 
 
215 aa  121  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  38.38 
 
 
206 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  39.04 
 
 
200 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  37.75 
 
 
231 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  33.83 
 
 
200 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  36.79 
 
 
209 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  41.27 
 
 
215 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  34.9 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  34.9 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  36.32 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  34.9 
 
 
197 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  99  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  37.88 
 
 
217 aa  98.2  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  33.68 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  36.84 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  34.9 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  34.17 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  35.47 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  36.65 
 
 
198 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  34.03 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  34.62 
 
 
175 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  34.67 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  35.59 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.92 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  34.72 
 
 
198 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  34.04 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  32.66 
 
 
242 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  31.87 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  32.64 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  34.55 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2917  hypothetical protein  45.26 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000179463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  30.24 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  29 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  29.35 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  34.44 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  62.26 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  37.14 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  38.66 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  25.13 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  28.35 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  40.66 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  30.77 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  52.83 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  25.13 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  46.84 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  59.26 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  28.95 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  39.22 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  27.64 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  27.94 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  28.95 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  28.22 
 
 
190 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  44.78 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  46.77 
 
 
152 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  26.74 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  36.79 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  27.6 
 
 
284 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  32.74 
 
 
148 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  47.46 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  37.78 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  42.65 
 
 
168 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  56.82 
 
 
154 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  44.44 
 
 
162 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  28.1 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  47.27 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  36.76 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  28 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  45.61 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  32.31 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  27.49 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  32.19 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  36.49 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  36.59 
 
 
270 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  43.4 
 
 
157 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  29.86 
 
 
166 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  32.39 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  44.23 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  40.98 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 
142 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  32.95 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>