113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6436 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  49.31 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  45.83 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  45.13 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  45.59 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  43.19 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  45.41 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  43.32 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  38.24 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  38.83 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  41.84 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  38.39 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  38.39 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  40.31 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  39.2 
 
 		 200 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  38.39 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  37.31 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  39.23 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  38.12 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  37.56 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  37.56 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  35.35 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  37.11 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  33.16 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  36.87 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  32.35 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  31.09 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  36.22 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  36.73 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  34.34 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  34.34 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  30.73 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  31.55 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  33 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  31.16 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  30.15 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  33.01 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  30.23 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  30.23 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  30.23 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  31.71 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  30.65 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  40.37 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  30.3 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  55.22 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  28.43 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  32.84 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  29.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  63.16 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  29.12 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  29.21 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  52.46 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  26.73 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  30.96 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  53.73 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  26.4 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  27 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  44.78 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  52.05 
 
 		 162 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  58.49 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  50.94 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  61.54 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  51.79 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  50.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  52.54 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  26.45 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  51.92 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  25.74 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  47.37 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  48.21 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  39.77 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  37.93 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 		 154 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  38.64 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  27.23 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2917  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000179463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  29.03 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  39.18 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  37.08 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  40.38 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3032  hypothetical protein  32.71 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  44.64 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  42.37 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  34.02 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  42.31 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>