24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0580 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  447  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  49.55 
 
 
228 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  29.95 
 
 
219 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  36.55 
 
 
227 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  33.19 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  24.33 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  40.37 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  21.59 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  22.52 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  36.54 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  37.74 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  39.29 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  26.32 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  42.05 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  38.55 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  33.9 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2081  membrane protein-like protein  24.66 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  33.33 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  39.73 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  26.36 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  39.76 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  34.02 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  34.94 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>