34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08380 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  420  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  33.79 
 
 
228 aa  144  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  30.32 
 
 
227 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  28.46 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  29 
 
 
235 aa  92  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  32.14 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  39.13 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  25.65 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  35.04 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  31.48 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  28.33 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  34.91 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  36.61 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  33.04 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  37.21 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  36.36 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  29.17 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  28.46 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  28.46 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  28.46 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  32.73 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  32.43 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  32.38 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  30.91 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01243  hypothetical protein  39.22 
 
 
61 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  35.23 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  27.52 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1305  hypothetical protein  29.71 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000716173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  27.52 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3032  hypothetical protein  25.62 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>