26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0452 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  32.52 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  29.67 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  27.88 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  26.4 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  29.79 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  27.54 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  27.17 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
217 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  37.04 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  25.4 
 
 
270 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  33.72 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  32.93 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  34.94 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  35.29 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  37.18 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  23.08 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  30.39 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  30.12 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  32.14 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  30.38 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  30.47 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  30.12 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  34.15 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>