32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2118 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  33.79 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  30.57 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  34.04 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  25.28 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  25.42 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  26.07 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  37.14 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  38.14 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  46.32 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  39.29 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  26.4 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  39.77 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  37.96 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  37.78 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  35.63 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  28.23 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2081  membrane protein-like protein  24.53 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  33.72 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  32.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  36.05 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  37.08 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  36 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  29.29 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  38.1 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  31.96 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>