92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3297 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  45.08 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  42.31 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  43.01 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  40.21 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  39.34 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  40.1 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  40.1 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  40.1 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  39.69 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  41.15 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  38.12 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  37.37 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  36.36 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  38.07 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  36.54 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  35.42 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  39.57 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  33.5 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  34.03 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  34.36 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  36.72 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  31.75 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  32.64 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  35.45 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  33.16 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  31.87 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  31.82 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  32.06 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  37.97 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  30.46 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  31.38 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  29.47 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  31.94 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  32.89 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  29.53 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  31.96 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  28.8 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  29.26 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  27.66 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  27.75 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  40.62 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  31.48 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  27.13 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  45.9 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  30.85 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  41.18 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  30.53 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  28.42 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  28.04 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  38.67 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  41.79 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  39.74 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  33.72 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  41.82 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  39.71 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  24.86 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  39.08 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  40.28 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  29.45 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  36.47 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  43.86 
 
 		 297 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  30.23 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  37.74 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6038  hypothetical protein  39.68 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  35.8 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  39.62 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  35.06 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  29.03 
 
 		 186 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  38.57 
 
 		 156 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>