12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6589 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  35.47 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  27.68 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  36.42 
 
 		 234 aa  85.5  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  28.51 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  25.42 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  28.23 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  25.65 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  23.3 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  30.84 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  30.91 
 
 		 221 aa  45.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  32.95 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>