109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2159 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  55.1 
 
 
209 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  45.85 
 
 
215 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  47.03 
 
 
197 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  47.03 
 
 
197 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  47.03 
 
 
197 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  45.16 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  45.41 
 
 
200 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  42.7 
 
 
198 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  38.92 
 
 
230 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  41.71 
 
 
231 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  46.77 
 
 
219 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  41.09 
 
 
206 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  42.55 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  39.23 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  43.22 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  37.56 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  40.32 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  33.65 
 
 
204 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  35.5 
 
 
217 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  31.77 
 
 
200 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  39.74 
 
 
248 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  36.69 
 
 
242 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  35.08 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  30.81 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  34.69 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  30.21 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  31.46 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  36.17 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  34.21 
 
 
198 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.86 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  35.14 
 
 
175 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  31.31 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  32.99 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  28.5 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  34.71 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  35.23 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  25.7 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  29.95 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  27.72 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  30.05 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  31.18 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  57.14 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  29.26 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  33.97 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  30.54 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  34.85 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  32.09 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  23.43 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  48.57 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  34.03 
 
 
270 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  32.35 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  28.02 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  54.72 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  43.42 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  25.59 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  31.41 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  47.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  45.61 
 
 
165 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  46.97 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  44.07 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  51.85 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  39.39 
 
 
147 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  23.76 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  25.73 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  40.37 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  49.06 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  42.59 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  44.44 
 
 
141 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  48.44 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  41.07 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  40.62 
 
 
297 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  39.62 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 
158 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  42.59 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  46.43 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  30.77 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  35.14 
 
 
178 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  35.53 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  31.08 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  30.37 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  41.18 
 
 
292 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0317126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>