42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3422 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  32.99 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  33.86 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  28.41 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  26.34 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  27.84 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  26.92 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  26.92 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  26.92 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  26.94 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  27.53 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  28.67 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  31.45 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  24.46 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  24.73 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  25.13 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  29.34 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  29.03 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  29.75 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  28.21 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  27.94 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  31.45 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  24.51 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  25.12 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  28.42 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  26.88 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  29.28 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  27.46 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  27.56 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  26.67 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  32.5 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  26.81 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  30.77 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  29.09 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>