71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2048 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  86.81 
 
 
200 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  84.7 
 
 
211 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  74.05 
 
 
194 aa  267  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  40.88 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
200 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  38.67 
 
 
190 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  31.98 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  33.16 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  32.98 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  34.29 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  31.82 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  29.26 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  32.2 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  30.23 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  31.22 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  33.87 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.46 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  34.07 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  32.85 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  29.7 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  27.55 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  30.81 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  33.56 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  30.77 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  34.48 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  28.25 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  33.58 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  28.26 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  29.85 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  31.64 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  32.47 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  28.8 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  27.81 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  30.9 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  26.92 
 
 
197 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  28.93 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  30.26 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  31.41 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  30.17 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  51.67 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  32.62 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  40.24 
 
 
130 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  25.13 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  30.37 
 
 
230 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  32.4 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  27.51 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  27.33 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  25.73 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  25.16 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  25.97 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  25.7 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  46.43 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  29.92 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  38.16 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  38.1 
 
 
128 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  43.4 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  40.68 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  41.27 
 
 
147 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  38.6 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>