59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3765 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  40.72 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  26.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  26.37 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  26.84 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  28.73 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  22.11 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  30.71 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  25.77 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  26.98 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  24.87 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  25.27 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  24.14 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  24.16 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  25.7 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  25.54 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  25.7 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  27.5 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  25.13 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  26.06 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  22.89 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  24.37 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  24.86 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  20.79 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2917  hypothetical protein  29.49 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000179463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  27.55 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  23.65 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  25.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  23.03 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  26.67 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  30.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  26.74 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  20.53 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  20.21 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  23.95 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  23.56 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  22.42 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  24.57 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  20.3 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  23.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  27.48 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  26.88 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  24.86 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  39.29 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  23.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  24.24 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  23.57 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  34.85 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  24.55 
 
 		 217 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  20.2 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  24.83 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>