51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2917 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2917  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  267  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000179463  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
217 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  42.99 
 
 
204 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  40.37 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  33.91 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  25.62 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  29.91 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  30.7 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  32.8 
 
 
206 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  30 
 
 
217 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  28.7 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  30.97 
 
 
175 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  28.35 
 
 
242 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  37.97 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  30.7 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  29.66 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  29.66 
 
 
242 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  29.29 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  31.4 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  31.13 
 
 
215 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  27.93 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  32.69 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  30.28 
 
 
198 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  32.81 
 
 
234 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  24.11 
 
 
200 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  24.77 
 
 
211 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  27.07 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  29.25 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  25.45 
 
 
215 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  28.81 
 
 
196 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  32.14 
 
 
191 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  27.97 
 
 
229 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  29.66 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  25.71 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  29 
 
 
219 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  24.07 
 
 
245 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  25.78 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  25.47 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  24.75 
 
 
194 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  27.27 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  28.18 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1304  hypothetical protein  27.59 
 
 
225 aa  40.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000068499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  30.69 
 
 
206 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>