90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7061 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  48.02 
 
 
219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  40.8 
 
 
217 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  33.16 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  37.3 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  35.64 
 
 
206 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  32.49 
 
 
211 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  35.68 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  33.5 
 
 
194 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  36.04 
 
 
215 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  36.32 
 
 
248 aa  98.2  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  34.92 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  33.01 
 
 
245 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  34.34 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  33.86 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  33.51 
 
 
227 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  29.95 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  30.89 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  29.8 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  32.99 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  34.76 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  32.12 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  34.64 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  30.26 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  33.16 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  33.93 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  33.76 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  33.17 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  26.37 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  32.5 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  34 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  30.21 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  35.76 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  30.22 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  31.94 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  30.93 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  27.41 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  35.14 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  29.26 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  29.02 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  30.43 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  26.06 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  32.21 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  33.1 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  31.08 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  28.04 
 
 
242 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  46.55 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  43.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  42.11 
 
 
166 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  39.34 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  44.64 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  35.53 
 
 
146 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  29.17 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 
128 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  41.79 
 
 
141 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  47.27 
 
 
142 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  34.13 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  38.96 
 
 
213 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  31.94 
 
 
230 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  41.07 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1660  hypothetical protein  25.13 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  38.33 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  41.67 
 
 
154 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  41.51 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8806  hypothetical protein  32.91 
 
 
176 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  25.26 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2917  hypothetical protein  34.18 
 
 
133 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000179463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  34.25 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  40.74 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  34.15 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  50.94 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  41.38 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  36.51 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  36.54 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>