61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5024 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  42.77 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  29.38 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  28.25 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  28.25 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  28.25 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  29.71 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  26.34 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  29.61 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  26.73 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  27.68 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  27.12 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  29.44 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  29.32 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  26.06 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  31.45 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  32.21 
 
 
284 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  25.51 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  28.32 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  27.87 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  30.07 
 
 
276 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  25.57 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  25.97 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  25.79 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  26.06 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  25.67 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  29.55 
 
 
227 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  26.16 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  28 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  25.79 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  27.45 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  24.73 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  28.39 
 
 
208 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  26.26 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  32 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  25.62 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  27.78 
 
 
229 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  27.43 
 
 
230 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  27.27 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  23.86 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  28.49 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  30.6 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  45.28 
 
 
168 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  23.47 
 
 
242 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  37.88 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  37.29 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  25.28 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  23.9 
 
 
217 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  30.17 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  24.71 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  24.18 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  26.53 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  29.65 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  28.1 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  27.47 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>