62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0220 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  40.8 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  37.91 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  33.17 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  30.84 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  32.16 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  32.06 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  28.9 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  29.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  30.19 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  28.23 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  28.17 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  30.19 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  30.17 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  28.67 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  28.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  25.42 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  46.77 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  27.72 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  28.97 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  28.97 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  28.97 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  28.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  26.89 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  26.67 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  29.19 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  27.83 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  36.25 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  41.38 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  25.61 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  44.83 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  27.49 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  23.9 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  28.67 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  24.88 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  36.59 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  29.13 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  28.22 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  39.19 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  35.59 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  40.62 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  26.98 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  41.82 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  43.4 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  41.27 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  42.11 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  25.9 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  37.74 
 
 		 192 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  23.19 
 
 		 186 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  26.07 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  24.83 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>