45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  100 
 
 		 130 aa  249  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  41.88 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  34.53 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  43.28 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  41.77 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  41.77 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  43.02 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  32.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  43.37 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  40.68 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  43.14 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  35.58 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  38.27 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  35.37 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  42.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  42.47 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  44.83 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  32.41 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  46.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  36.61 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  31.88 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  39.53 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  42.25 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  40.35 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  33.62 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  36.44 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  37.88 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  42.03 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  41.82 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  34.31 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  40.98 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  35.82 
 
 		 219 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  42.11 
 
 		 215 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 218 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>