54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3836 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  55.36 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  41.79 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  44.83 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  47.17 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  39.39 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  40.68 
 
 		 130 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  39.29 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  32.28 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  41.33 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  28.97 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  42.59 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  47.17 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  43.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  41.33 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  37.18 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 		 219 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  45.1 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  30.26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  39.62 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  42.67 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  46.3 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  41.79 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  36.25 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  36.92 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  31.67 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  26.32 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  41.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  42.31 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  39.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  42.31 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  42.31 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  41.43 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  32.62 
 
 		 128 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 		 242 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 		 234 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  37.1 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  37.74 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  31.34 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  35.19 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  29.75 
 
 		 297 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>