92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7193 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  53.37 
 
 
190 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  39.15 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  41.49 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  33.01 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  48.08 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  41.46 
 
 
113 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  38.32 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  38.46 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  32.17 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  37.67 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  39.56 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  33.64 
 
 
123 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  34.33 
 
 
122 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  37.36 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  30.25 
 
 
123 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  31.48 
 
 
442 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  37.97 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  38.67 
 
 
113 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  31 
 
 
166 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  33.64 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  33.64 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  34.59 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  38.46 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  39.64 
 
 
113 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  37.66 
 
 
157 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  48.94 
 
 
186 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  38.89 
 
 
192 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  40.68 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  39.39 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  53.33 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  35.29 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  38.1 
 
 
123 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  35.56 
 
 
133 aa  48.5  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  38.6 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  35.48 
 
 
118 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  35.48 
 
 
118 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  35.48 
 
 
118 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  39.62 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  32.26 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  46.15 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  39.62 
 
 
146 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  36.23 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  40.38 
 
 
161 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  36.36 
 
 
125 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  34.38 
 
 
118 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  43.64 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  35.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 
191 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  37.04 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  23.76 
 
 
116 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  35.85 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5457  hypothetical protein  37.35 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  37.84 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  29.9 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  29.55 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  23.71 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  35.09 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  32.43 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  27.22 
 
 
147 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  32 
 
 
215 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  36.36 
 
 
179 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  32.5 
 
 
175 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  32.69 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  34.62 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  39.22 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>